构象敏感凝胶电泳快速检测HBV准种序列异质性的方法

• 作者: 兰林 王宇明
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 所属期刊栏目: 病毒性肝炎
• 页码范围: 411-414
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 5163字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2002.04.010

摘要

目的:建立一种快速检测乙型肝炎病毒(HBV)准种遗传异质性的方法并验证其敏感性和特异性.以满足研究HBV准种需要检测大量病毒序列的要求.方法:在构象敏感凝胶电泳(CSGE)检测方法的基础上,针对HBV核酸序列组成的特殊性,调整凝胶中使用的甲酰胺和乙二醇浓度并加入一定量的尿素,另外通过一次预电泳优选驱动序列.最后用改进地CSGE检测已知序列的HBV C-ORF区片段克隆,并把检测结果与DNA序列分析结果进行比对,验证该方法的敏感性和特异性.结果:用改进地CSGE检测克隆的HVC C-ORF区片段获得了清楚地电泳图谱.对已知序列的HBC C-ORF区克隆片段进行检测:在34个克隆中发现了27种不同的克隆型,准种内病毒株(克隆)频率介于2.9～17.6%,克隆型之间的遗传距离介于0.2～2%.CSGE所得结果与DNA序列分析结果高度一致.结论:我们建立的CSGE具有高度的敏感性和特异性,完全可以用于检测HBV准种序列的异质性及其他相关研究

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	兰林	中国人民解放军第三军医大学西南医院全军感染病研究所	5	36	4.0	5.0
2	王宇明	中国人民解放军第三军医大学西南医院全军感染病研究所	55	380	11.0	14.0