与实验条件相关的基因功能模块聚类分析方法

• 作者: 喻辉 屠康 李霞 郭政
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因功能模块 特征功能模块 聚类分析
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 225-232
• 页数: 8页
• 分类号: Q617
• 字数: 6060字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2004.03.011

摘要

针对细胞内基因功能模块化的现象,定义了"基因功能模块"和"特征功能模块"两个概念,并基于这两个概念提出一种"与实验条件相关的基因功能模块聚类算法".该算法综合利用基因功能知识与基因表达谱信息,将基因聚类为与实验条件相关的基因功能模块.向基因表达谱中加入水平逐渐升高的数据噪音,根据基因功能模块对数据噪音的抵抗力,确定最稳定的基因功能模块,即特征功能模块.加噪音实验显示,在基因芯片技术可能发生的噪音范围内,该算法对噪音的稳健性优于层次聚类和模糊C均值聚类.将模块聚类算法应用在NCI60数据集上,发现了8个与实验条件高度相关的特征功能模块.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭政	哈尔滨医科大学医学数学与生物医学工程学教研室	43	323	11.0	16.0
3	李霞	哈尔滨医科大学医学数学与生物医学工程学教研室	108	479	12.0	18.0
4	屠康	哈尔滨医科大学医学数学与生物医学工程学教研室	8	103	4.0	8.0
7	喻辉	哈尔滨医科大学医学数学与生物医学工程学教研室	3	24	3.0	3.0