基于功能模块的基因表达谱聚类分析

• 作者: 张田文 王海芸 王琦 郭政
• 来源期刊: 同济大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 基因表达谱 功能表达谱 基因功能分类体系 聚类
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 计算机与信息工程
• 页码范围: 264-269
• 页数: 6页
• 分类号: Q344.13|TP391.4
• 字数: 5370字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-374X.2006.02.025

摘要

按GeneOntology基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NCI60数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚类分析.结果显示,新算法不但得到高准确度的样本分型结果,而且能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.同时,用基于功能表达谱对组织样本进行聚类分析可以显著降低特征维数,有效地处理高检测误差与基因表达变异问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭政	哈尔滨医科大学生物信息学系	43	323	11.0	16.0
4	张田文	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	101	1786	19.0	39.0
5	王琦	哈尔滨医科大学生物信息学系	34	121	7.0	9.0
12	王海芸	哈尔滨医科大学生物信息学系	3	28	3.0	3.0