石油降解菌株G5 16S rDNA全序列的系统学分析

• 作者: 洪斌 王丽非
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 16S rDNA 石油 微生物降解 假单胞菌
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 页码范围: 363-365
• 页数: 3页
• 分类号: Q78:X172
• 字数: 2185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1006-687X.2004.03.023

摘要

用PCR方法扩增了一株石油降解菌株G5的16S rRNA基因全序列,并对其进行了克隆和测序.对该序列在GenBank中的BLAST结果表明,所有与该序列高度同源的序列都是假单胞菌的16S rRNA基因.其中假单胞菌的代表菌株Pseudomonas aeruginosa, P. fluoroscens, P. putida, P. syringae的16S rRNA基因序列与G5的16S rRNA基因序列同源性分别为93.4%, 98.4%, 96.3%, 97.5%.对G5和其他39株假单胞菌的16S rRNA基因序列进行聚类分析,获得的系统发育树与RDP(Ribosomal Database Project)报道的系统发育树基本一致,其中菌株G5与5株P. chlororaphis聚类在一起. 图2 参7

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	洪斌	中国医学科学院医药生物技术研究所	20	168	7.0	12.0
2	王丽非	中国医学科学院医药生物技术研究所	6	40	3.0	6.0