一种种系发生分析的新方法

• 作者: 吴常信 徐建华 李宁 樊宝良 胡晓湘 赵志辉 邓学梅
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 农学
• 关键词: 物种 种系发生分析 表达序列标签 突变
• 年，卷（期）: 2004,（10）
• 所属期刊栏目: 动物遗传学
• 页码范围: 1109-1115
• 页数: 7页
• 分类号: S813.1
• 字数: 3870字
• 语种: 中文

摘要

利用所测定的猪脂肪组织表达序列标签以及来源于GenBank中非冗余核酸数据库和表达序列标签数据库中的人、牛及小鼠cDNA序列,在随机抽样方法建立的基础上,分别采集70个已知功能基因的cDNA序列,分析了4个物种70×150 bp序列连接体的突变规律,建立了不同物种之间的综合种系发生分析方法.结果表明,在4个物种70个已知功能基因所构成的cDNA序列连接体同源性分析中,共发现391个单碱基突变,不同物种之间的突变数量大大超过了同一物种基因组水平预测的1/1000.其中以C/T(T/C)转换和A/G(G/A)转换为主要的单碱基突变类型.种系发生分析结果表明,作为偶蹄目的猪和牛的遗传关系最近,其次是人类,小鼠与家猪和牛的遗传关系最远.4种动物从共同祖先分化的顺序分别为小鼠最早,人类次之,然后为猪和牛.