中国对虾微卫星DNA引物的设计及筛选

• 作者: 刘萍 孔杰 张天时 王清印
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 中国对虾 微卫星 基因组文库 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2004,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 567-571
• 页数: 5页
• 分类号: Q959.223
• 字数: 2905字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2004.06.014

摘要

根据建立的中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)部分基因组文库,对筛选的含微卫星DNA序列的克隆设计了28对引物,筛选出5对微卫星多态性引物,并用这5对引物对中国对虾的养殖群体20个个体进行了遗传多样性分析.在这5个微卫星位点中,虽然RS0871位点是多态位点,但其等位基因数、杂合度和多态信息含量都比较低.其余4个微卫星位点可产生6～8个等位基因,等位基因的大小分布在142～364 bp,基本上符合引物设计时理论产物长度.这些微卫星位点的期望杂合度的范围为0.757 7～0.806 4,表明它们都有较高的杂合度.仅有位点RS0956的观察杂合度与期望值有较大的出入,其他微卫星位点的这两值基本相符.有4个微卫星位点的PIC值较高,在0.718 0～0.770 9.因此,除RS0871位点以外的4个微卫星位点均可用于中国对虾种群遗传结构分析,这将为中国对虾品种选育、种系评估提供更多的微卫星DNA信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	孔杰	中国水产科学研究院黄海水产研究所	89	2666	34.0	49.0
3	王清印	中国水产科学研究院黄海水产研究所	118	3069	34.0	50.0
4	张天时	中国水产科学研究院黄海水产研究所	18	442	11.0	18.0