以中国海南岛地区表现束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)症状的香蕉组织总DNA为模板,通过PCR方法克隆了BBTV海南分离物的6个DNA组分全序列,并进行了核苷酸序列分析.测序结果表明,DNA1~6序列全长分别为1104、1067、1059、1045、1014和1081 nt,均已登录到GenBank(登录号分别为AY450396、AY606084、AY494786、AY494788、AY606085和AY494787).与世界不同地域分离物进行序列同源分析,发现DNA1序列较保守,与越南分离物的同源性达到了95.4%;而DNA2和DNA4变异较大,其中DNA2序列与广州分离物的同源性仅有83%.根据DNA1的序列差异分析初步确定BBTV海南分离物属于亚洲亚组.