口蹄疫OX株全基因组cDNA的分子克隆、序列测定及分析

• 作者: 刘湘涛 孙世琪 尚佑军 谢庆阁 郭慧琛 靳野 韩雪清 马军武 魏旭文
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 全基因组 分子克隆 序列比较
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 兽医
• 页码范围: 454-458
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65+9.6
• 字数: 3585字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2004.04.020

摘要

采用RT-PCR法对FMDV OX株基因组全序列进行了分子克隆与测序.结果表明不含poly(C)序列和poly(A)尾巴的OX株基因组全序列长8 104nt,开放读码框(ORF)长6 969nt、编码2 322aa,5′UTR长1 040nt,3′UTR长95nt.应用分子生物学软件将OX株与FMDV其它参考毒株进行序列比较,并对其基因特征进行分析.结果显示,OX株与OTwyl/97的核苷酸同源性最高,在基因组功能未知区和3A编码区具有两处明显的缺失现象,其一是在3A编码区有30nt的连续缺失,这与OTwyl/97株相同,其二是在功能未知区域有44nt的缺失,这与OTwyl/97株相同,与OAkesu58相似(43nt缺失).