基于PC/Linux蛋白序列分析系统的构建及应用

• 作者: 吴文言 寸树健 杨彦臻 邓日强 邓百煌
• 来源期刊: 中山大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: linux blast emboss phylib 生物信息学工作站
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 页码范围: 80-82
• 页数: 3页
• 分类号: Q754
• 字数: 3177字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0529-6579.2004.05.023

摘要

介绍利用常见的x86 PC,Linux操作系统配合BLAST、PHYLIB和EMBOSS等常见的生物分析软件构建可以完成多种蛋白数据分析的大规模自动分析系统.该系统可自动完成从DNA序列中获取读码框、核酸序列向蛋白序列的转化、在蛋白序列数据库中查找同源序列、序列录入数据库以及蛋白序列的等电点、亲/疏水位点、二级结构等性质的分析、多个序列之间相似度和进化地位的分析,并对输出的结果数据利用Web服务器进行发布.与传统的序列分析模式相比,此分析系统大大加速了对大规模数据信息的分析和利用.