基于Linux的cDNA文库序列分析平台的构建与应用

• 作者: 代翠红 朱延明 李勇 李杰 柏锡 纪巍
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: cDNA分析 EST Linux 生物信息学 电子延伸
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 124-127
• 页数: 4页
• 分类号: TP316.8|TP274
• 字数: 3315字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2006.03.008

摘要

本研究构建了基于Linux的cDNA文库序列分析平台,该分析平台可大批量自动处理测序后的序列,包括载体序列的去除、序列格式的转换、序列的自动拼接、序列对数据库的相似性搜索及全长ORF的预测等,可加速对大规模测序数据的分析和利用.用该平台对构建的野生大豆盐胁迫全长cDNA文库部分测序结果进行分析和利用.用该平台对构建的野生大豆盐胁迫全长cDNA文库部分测序结果进行分析,获得了较好的结果,已得到多个具有潜在价值的新基因序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李勇	东北农业大学植物生物工程研究室	41	568	14.0	22.0
2	柏锡	东北农业大学植物生物工程研究室	80	891	15.0	26.0
3	纪巍	东北农业大学植物生物工程研究室	44	518	13.0	21.0
4	朱延明	东北农业大学植物生物工程研究室	125	1696	22.0	34.0
5	李杰	东北农业大学植物生物工程研究室	193	1723	20.0	30.0
6	代翠红	东北农业大学植物生物工程研究室	6	101	3.0	6.0