仿刺参cDNA文库构建以及序列分析

• 作者: 丛丽娜 徐赛涛 朱蓓薇
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 仿刺参 cDNA文库 蛋白水解
• 年，卷（期）: 2007,（z1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 分类号: Q785
• 字数: 4344字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2007.z1.002

摘要

应用Gubler-Hoffman cDNA Library Construction技术,构建仿刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库.测试结果表明,库容量为2.0×106 pfu/mL,利用PCR方法检测cDNA文库插入DNA片段的大小,其长度范围在0.5～4.1 kb,插入片段平均长度为1.3kb,表明该文库达到建库要求,可用来筛选低丰度mRNA的基因克隆.随机挑选100个1kb以上的cDNA克隆进行测序分析,发现有25条EST序列和网上公布的其他物种的序列相似性较高,这些基因与刺参能量代谢和蛋白水解相关.其中发现的几个重要基因,如编码遍在蛋白以及缬酪肽蛋白等的基因,可能与仿刺参自溶过程的蛋白酶水解和细胞凋亡事件相关,进一步的研究还在进行.另有49条EST序列相似性较低,推测可能是功能未知的新基因.仿刺参cDNA文库的成功构建,为下一步大量EST序列分析和功能性新基因的发现,以及从基因水平认识仿刺参这一特殊棘皮动物的生长、发育和代谢规律奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱蓓薇	大连工业大学生物与食品工程学院	67	1132	20.0	29.0
2	丛丽娜	大连工业大学生物与食品工程学院	57	255	8.0	14.0
3	徐赛涛	大连工业大学生物与食品工程学院	2	19	2.0	2.0