刺参管足SMART cDNA文库构建及EST分析

• 作者: 丁君 常亚青 李栋 王玉丹
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 刺参 管足 cDNA文库 EST分析
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 193-198
• 分类号: Q78
• 字数: 5373字
• 语种: 中文

摘要

以大连广鹿岛野生刺参的管足mRNA为材料,利用SMART cDNA Construction Kit构建了表达型cDNA文库.初始文库的滴度为1.3 × 106PFU/mL,蓝白斑估测量组率合格.扩增后获得96 mL文库,滴度为1.8 × 1010PFU/mL,从扩增文库中随机挑取200个噬菌斑进行PCR检测,电泳检测结果表明重组率大于90％,片段大小在0.25 -2.0 kb之间的插入片段占80.4％,文库构建成功.随机选择122个噬菌斑转化为质拉pTriplEx2并测序,测序成功率83.6％,软件处理后100 bp以上的clean ESTs有72条,测通的为65条,占成功测序样品的63.7％.72条序列经SeqMan软件拼接,获得48条conting/singletons,在线Blast比对发现其中26条具有同源序列并获得注释,另外20条可能为新基因,其功能和结构有待进一步利用生物信息学的方法进行分析和研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁君	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	47	394	13.0	17.0
2	常亚青	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	142	766	15.0	19.0
3	李栋	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	16	20	2.0	4.0
4	王玉丹	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	1	2	1.0	1.0