生物胺受体配基结合区域及其位点的预测

• 作者: 岳俊杰 张怀渝 梁龙 王月兰 郭志云 黄培堂
• 来源期刊: 生物物理学报
• 关键词: 生物胺受体 配基 motif 生物信息学 功能中国分类号:Q71
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 95-102
• 页数: 8页
• 字数: 4887字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2005.02.003

摘要

生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标,用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能,对于药物设计具有重要的指导意义.从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型,预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ,其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用,E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程,这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸.从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif,提出了父家族可变子家族保守motif概念,即父家族可变区中出现的子家族保守的motif.最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能,预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点,结果证明与突变实验结果有很好的吻合度.