禽流感病毒分离株NS基因同源性及等位基因类型分析

• 作者: 孙明 王传彬 王宏伟 田克恭 赵铁柱 遇秀玲 陈西钊
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 医学
• 关键词: 等位基因 序列同源性,氨基酸
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 专论(二)
• 页码范围: 11-15
• 页数: 5页
• 分类号: R373.1
• 字数: 3491字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2005.01.003

摘要

目的克隆测定国内具有代表性的禽流感病毒(AIV)的非结构(NS)蛋白基因核苷酸序列,分析其同源性和等位基因类型,为进一步探索禽流感NS蛋白抗体监测方法奠定基础.方法经RT-PCR扩增了国内3株H9N2、2株H5N1、2株H7N2亚型AIV分离株的NS蛋白基因,并把扩增的基因片段克隆到pGEM-T载体中测序,将测序结果与GenBank中的核苷酸序列进行同源性比较,绘制基因进化树.结果经测序获得了各AIV分离株NS基因的完整编码序列.同源性分析表明,3株H9亚型AIV的NS基因之间的同源性为96%～98%;两株H5亚型AIV NS基因同源性为91.6%;两株H7亚型AIV的NS基因同源性为98.9%.H5和H9亚型分离株的NS基因之间的同源性均高于90%;而H7N2亚型分离株与其它两种亚型分离株的NS基因同源性约为60%～70%.在AIV NS基因系统发育进化树中, H5、H9亚型分离株都处于等位基因A群内;3株H9亚型分离株的进化关系较近,与香港、广东的部分H5N1病毒株起源相同,而2株H5病毒的NS基因则处于不同分枝内;2株H7亚型分离株的NS基因都处于等位基因B群内,进化关系较近.结论这7株国内AIV分离株的NS基因之间的同源性差异较大,约为60%～99%,且包括A、B两种类型的等位基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵铁柱		12	64	5.0	7.0
2	孙明		19	131	7.0	10.0
3	遇秀玲		17	137	5.0	11.0
4	陈西钊		22	220	8.0	14.0
5	田克恭		43	453	11.0	19.0
6	王传彬		18	271	8.0	16.0
7	王宏伟		13	131	7.0	11.0