条斑紫菜(Porphyra yezoensis)dbEST中筛选微卫星位点及引物种间转移扩增

• 作者: 刘必谦 厉盛华 曾庆国 王亚军 骆其君
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 生物学
• 关键词: 条斑紫菜 表达序列标签 微卫星 种间转移扩增
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 页码范围: 248-254
• 页数: 7页
• 分类号: Q789
• 字数: 3220字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0029-814X.2005.03.009

摘要

采用电子查询的方法,借助Blast软件从条斑紫菜表达序列标签数据库的20979条序列中筛选微卫星位点,共发现非冗余微卫星位点211个,占整个条斑紫菜EST数据库的1.01%.其中双碱基重复微卫星位点共有35个,占查找微卫星序列总数的16.6%;三碱基微卫星有176个,占83.4%.双碱基重复微卫星中AG/CT形式最多,而三碱基中GGC/GCC最多.从筛选出的微卫星位点中选取序列设计合成引物,用在坛紫菜上进行引物种间转移扩增研究.在总共15对引物中有13对引物在两个种间都有扩增产物.结果表明,微卫星位点在这两种紫菜之间具有很高的同源性.获得的微卫星引物可用来进行种群遗传多样性研究、谱系鉴定和遗传图谱的构建.而微卫星标记的共显性可用来进行紫菜二倍体丝状体纯合性检验,为纯系紫菜品系的鉴定提供分子生物学鉴定方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘必谦	宁波大学海洋生物工程重点实验室	38	635	14.0	24.0
2	曾庆国		4	70	3.0	4.0
3	王亚军	宁波大学海洋生物工程重点实验室	32	485	11.0	21.0
4	骆其君	宁波大学海洋生物工程重点实验室	70	640	14.0	22.0
5	厉盛华	宁波大学海洋生物工程重点实验室	3	61	2.0	3.0