GNU PATTERN:基于SPLASH算法的开源生物序列模式识别程序

• 作者: LI Yi-xue 孔祥银 许颖
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: GNU PATTERN SPLASH算法 模式识别
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 265-269
• 页数: 5页
• 分类号: Q61
• 语种: 中文

摘要

目的获取IBM SPLASH算法核心代码,为进一步开展生物序列模式识别研究提供一个高效算法引擎.方法基于SPLASH算法开发核心代码,运用开源软件工具,开发、调试和优化程序.结果开发出GNU Pattern(Gpat)程序,高效实现了SPLASH算法的核心部分,并提供全部源码,其他研究人员可以在GNU许可协议下修改该程序.结论Gpat成功地实现了SPLASH算法,并为下游生物序列模式识别研究提供铺垫.