小样本情况下差异表达基因鉴别的参数统计分析

• 作者: XIANG Zhaoying 武建虎 贺佳 贺宪民
• 来源期刊: 中国卫生统计
• 学科: 医学
• 关键词: 差异表达基因 随机方差模型 SAM 对数后验比法
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 141-145
• 页数: 5页
• 分类号: R1
• 字数: 4531字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3674.2005.03.004

摘要

目的探索小样本情况下基于不同理论的统计方法在鉴别差异表达基因时的性能.方法以实验资料为基础,估计残差方差的分布参数、基因的平均表达及差异表达水平,按照一定差异比例模拟理论数据,用于分析倍数法、t检验、随机方差模型、SAM及对数后验比法的性能及特征.结果随机方差模型、SAM及对数后验比法在鉴别差异表达基因的准确性上相近,均高于t检验和倍数法,t检验又稍高于倍数法.结论倍数法的性能受极端值的影响严重,t检验在基因特异性标准误较小情况下增加鉴别的假阳性率,而随机方差模型、SAM和对数后验比法由于统计量的计算建立在多基因的基础上,鉴别的准确性较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺佳	第二军医大学卫生统计学教研室	186	2347	26.0	40.0
2	贺宪民	第二军医大学卫生统计学教研室	23	586	12.0	23.0
3	武建虎	第二军医大学卫生统计学教研室	6	115	4.0	6.0