基于基因功能表达谱的疾病分类:抗基因缺失的稳健性

• 作者: 张田文 李霞 王琦 郭政
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达谱 基因功能表达谱 Gene Ontology(GO) 决策树 稳健性
• 年，卷（期）: 2005,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 78-81
• 页数: 4页
• 分类号: Q81
• 字数: 3469字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2005.06.018

摘要

利用基因表达谱数据,按 Gene Ontology基因功能分类体系,将基因模块化地组织到具有显著生物学意义的低维差异表达功能模块单元中,构造新的指标用于分类疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的分析新途径.新算法可稳健地抗基因检测缺失,抗基因表达变异,抗检测误差,并可以显著地降低分类特征维数(参与疾病分类的基因数目).采用淋巴瘤数据集,比较了基于功能表达谱和常规的基因表达谱的决策树分类器.结果显示,基于功能表达谱可以得到高准确度的疾病样本分类结果,能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.通过仿真分析,进一步显示了基于功能表达谱的分类方法具有抗基因检测缺失的稳健性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭政	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	43	323	11.0	16.0
4	李霞	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	108	479	12.0	18.0
7	张田文	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	101	1786	19.0	39.0
11	王琦	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	41	248	9.0	14.0