cDNA芯片缺失值处理对基于基因表达谱的疾病分类的影响

• 作者: 吕莹丽 朱晶 李霞 王晨光 王栋 郭政
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达谱 缺失值 分类
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 501-505
• 页数: 5页
• 分类号: Q81
• 字数: 5286字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2006.05.012

摘要

选取了4套cDNA芯片数据,分别运用补零和K近邻的方法,对有检测缺失的基因进行了补缺失值处理,分析了不同处理对支持向量机、K近邻分类器、决策树三种分类器分类效能的影响.结果显示: 在cDNA基因表达谱数据中,对检测缺失率不高于5%的基因补缺失值是一种较好的策略,这样可以保留较多的基因供后续的功能分析,同时仍然能够保持很高的疾病分类效能.