三种猫科动物MHC Class Ⅱ DRB等位基因序列变异性分析

• 作者: 吴孝兵 晏鹏 王倩
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: MHC基因 DRB座位 第二外元 猫科动物 变异性
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 181-188
• 页数: 8页
• 分类号: Q959.838|Q959.838.03
• 字数: 6541字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5853.2006.02.009

摘要

分析了云豹(Neofelis nebulosa)、豹(Panthera pardus)和东北虎(Panthera tigris altaica)等3种猫科动物的主要组织相容性复合物ClassⅡDRB座位的等位基因序列变异性.使用一对简并性引物扩增了DRB座位第二外元目标片段.用单链构像多态性分析方法确定不同的单倍型.每个个体挑出15个单克隆用来分离、纯化和测序.实验中从4个个体中获得了8种不同序列.237 bp核苷酸序列中发现有59个变异位点.根据人类的抗原肽结合区推测79个氨基酸位点中存在21个假定的抗原肽结合位点,而且非同义替换率明显高于同义替换率,这可能说明了第二外元的较高变异性是由平衡选择作用来维持的.重建的NJ树和MP树显示豹和东北虎的亲缘关系较近,而两者与云豹的亲缘关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴孝兵		5	39	3.0	5.0
2	晏鹏		3	26	2.0	3.0
3	王倩		1	6	1.0	1.0