班皮桉及其近邻树种CCR基因分子变异分析

• 作者: Merv Shepherd 梁一池 陈碧华
• 来源期刊: 西南林学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: 伞房属(哥伦比亚属) 班皮桉 肉桂酰辅酶A还原酶 分子变异 系统进化树
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S792.390.1
• 字数: 3864字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1914.2006.05.001

摘要

选取伞房属班皮桉及其近邻树种共5部类16个样本提取基因组DNA,用2对引物进行PCR扩增,采用凝胶直接纯化,改进测序反应后测序.以Eucalyptus gunnii CCR作对照,通过ClustalW进行比对分析序列变异和MEGA 3进行系统进化分析.结果显示:在所得到的伞房属16个样本CCR序列中,A,C,G和T 4种核苷酸所占比例分别为24.92%,23.18%,23.22%和28.67%,A+T含量明显高于G+C.共发现292个变异位点,占分析位点总数的9.71%,变异除118个转换和97个颠换外,有93个位点的插入/缺失,其中简约信息位点185个,占63.36%.部分变异位点重叠.转换与颠换比值为1.22∶1.11.CCR系统发育树显示:E.gunnii是一个单独分枝,5部类亲缘可以分辨开来,Rufaria尤其明显.Rufaria最早产生分歧,其次是Ochraria和Cadagaria,Blakearia分歧属最迟进化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁一池	福建农林大学林学院	31	683	12.0	25.0
2	陈碧华	福建农林大学林学院	28	224	9.0	13.0