中国内陆发现HCoV-HKU1感染及N和S蛋白基因序列及进化分析

• 作者: 侯云德 刘文培 彭夫望 段招军 漆正宇 瞿小旺 谢志萍 高寒春 黄灿平
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 呼吸道感染 SARS冠状病毒 冠状病毒HKU1
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 241-247
• 页数: 7页
• 分类号: R373.1
• 字数: 4776字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2006.04.001

摘要

了解冠状病毒HKU1在我国大陆地区的感染情况及N基因和S基因的编码特征.采用RT-PCR的方法对2005年10月～2006年1月收集的260例急性呼吸道感染的住院儿童鼻咽抽吸物(NPA)进行了冠状病毒HKU1基因检测.将PCR阳性产物测序,并将所测序列在GenBank中进行比较分析.260份样本中共检测到2份冠状病毒HKU1阳性,阳性率为0.77%(2/260),且该2例冠状病毒HKU1阳性患者临床均表现为肺炎症状.扩增其中一株病毒N和S全基因,并进行测序,与GenBank中的冠状病毒HKU1参考株及冠状病毒科其它成员进行序列同源性和进化树分析,并对N和S蛋白的结构与功能进行了初步的预测分析.由此表明我国大陆地区存在冠状病毒HKU1感染,且可能与儿童下呼吸道感染存在相关性.