家蚕浓核病毒 Bm DNV-3(中国株)VD1基因组结构与转录分析

• 作者: 姚勤 王永杰 陈克平 韩序
• 来源期刊: 生物工程学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 家蚕浓核病毒 序列分析 转录分析
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 基因工程
• 页码范围: 707-712
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 5201字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3061.2006.05.003

摘要

为了进一步认识家蚕浓核病毒BmDNV-3(中国株)VD1基因组的结构和功能,VD1被分离、纯化、克隆到pUC119载体上,完成了基因组全序列的测定.序列分析显示VD1基因组全长为6543个核苷酸,末端拥有224个核苷酸反向重复序列(ITRs).VD1基因组正链含有3个大的开放阅读框(ORF1-3),负链含有1个大的开放阅读框(ORF4).比较BmDNV-3的VD1和BmDNV-2(Yamanashi isolate)的VD1基因组全序列,两者同源性为98.4%,并且有107个碱基的替代和1个碱基插入,氨基酸突变集中在VD1 ORF3和VD1ORF4.Northern杂交结果显示:VD1的左边正链上有1.1kb和1.5kb两个转录本,右边的负链上有一个3.3kb转录本.3'和5'-RACE结果显示:1.1kb转录本开始于nt 290,结束于nt 1437;1.5kb转录本开始于nt 1423,结束于nt 2931;3.3kb转录本开始于nt 6287,结束于nt 2922.正链上1.5kb转录本和负链上3.3kb转录本拥有10个核苷酸的3'端的共同序列.研究结果显示该病毒基因转录与已报道的其它浓核病毒存在较大的差异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈克平	江苏大学生命科学研究院	102	716	13.0	21.0
2	姚勤	江苏大学生命科学研究院	70	604	13.0	21.0
3	王永杰	江苏大学生命科学研究院	56	282	9.0	14.0
7	韩序	江苏大学生命科学研究院	3	45	3.0	3.0