一种MicroRNA duplex设计新技术研究

• 作者: 丁大鹏 周珏宇 石嵘 郑文岭 马文丽
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 微RNA siRNA 生物信息学分析 热动力学性质
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 109-112
• 页数: 4页
• 分类号: Q522|Q751
• 字数: 2919字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7847.2006.02.004

摘要

利用microRNA数据库,获取3种微RNA mir-181a、mir-124和mir-1的成熟序列信息.基于siRNA duplex在形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-induced silencing complex,RISC)过程中的不对称性的特点,初步设计了针对上述3种微RNA的microRNA duplex.采用生物学软件Oligo 6.0分别评价其热动力学特性,并通过改变反义链3'端个别碱基序列使其满足热动力学的需求,从而确定最终的设计序列.结果显示,利用RISC形成过程的不对称性,结合生物学软件Oligo 6.0的热动力学分析来设计miRNA duplex,是一种简便可行、准确有效的方法.