用RACE技术对一株肠道病毒3'端进行扩增和序列分析

• 作者: 侯俊 朱雷 沈宏辉 王志杰 胡燕 貌盼勇 雷厉
• 来源期刊: 中华实验和临床病毒学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒属 DNA 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 410-412
• 页数: 3页
• 分类号: R5
• 字数: 1689字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2006.04.037

摘要

目的 应用3'RACE技术对一株本室分离肠道病毒基因组3'末端进行扩增,并对其核苷酸序列进行比较分析.方法 提取病毒总RNA,以锚定oligdT(17)引物进行逆转录,用特异引物及锚定引物进行3'RACE扩增,将PCR产物进行克隆、测序和序列分析.结果 获得了该病毒的3'端核苷酸序列,同源性分析结果显示该肠道病毒的核苷酸序列与肠道病毒76、89、90、91型的同源性最高为90%左右,而与其他型别的肠道病毒的同源性均小于80%;推导的氨基酸同源性与肠道病毒76、89、90、91型均在90%以上.结论 用RACE技术对肠道病毒3'端进行扩增及序列分析,证明该病毒属新型肠道病毒类,为进一步研究该病毒的分子生物学特性奠定了基础.