贵州烟草上一株PVY坏死株系全序列测定与分析

• 作者: 张帅 杨金广 王凤龙 王永 申莉莉 钱玉梅
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 烟草 马铃薯Y病毒 全序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 47-51
• 分类号: S435.72
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5119.2011.01.011

摘要

2007年从贵州省贵定烟区采集一株呈典型马铃薯Y病毒坏死株系(Potato virus Y vein necrosis strain,PVYN)的烟草病毒病样,经PVY鉴别寄主枸杞(Lycium barbarum L.)单斑分离纯化后,于枯斑三生烟(Samsun NN)株上保存,得到PVY分离物Guiding-3.以GenBank中已有的PVY全序列为基础,设计了3对PVY特异引物.通过总RNA提取、RT-PCR及序列测定,发现所测得的PVY分离物Guiding-3全长基因组序列(NCBI登录号为HM590405)包括9 699个碱基,整条序列仅包含一个由9186个碱基组成的开放读码框(ORF),编码一条包含3 061个氨基酸的多聚蛋白.利用MEGA软件对所测得的 PVY全序列与GenBank中已有的PVY全序列进行系统进化分析,发现Guiding-3分离物的序列与PVYN、PVYNTN、PVYN:O、PVYO、PVYNNP株系的一致性分别为98%、97%、94%、92%、85%,在已有的PVY株系中,Guiding-3分离物与PVY~N株系具有较高的进化亲缘关系.另外,还对PVY的分子变异进行了初步讨论.