烟草PVYN辽宁分离物全序列测定与分析

• 作者: 吴元华 周本国 安梦楠 王芳 许大凤 高正良
• 来源期刊: 中国烟草学报
• 学科: 工学
• 关键词: 烟草 PVYN-LN 基因组全序列 重组分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 109-113
• 页数: 5页
• 分类号: TS413
• 字数: 2693字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-5708.2013.04.019

摘要

利用引起烟草脉坏死病的马铃薯Y病毒脉坏死株系辽宁分离物（Potato virus Y-vein necrosis strain Liaoning isolate, PVYN-LN），以GenBank中已有的PVY全序列为基础，设计特异引物。通过总RNA提取、RT-PCR、3’RACE和5’RACE扩增及序列测定，测得PVYN-LN全长基因组序列（NCBI登录号为JQ971975）包括9714个碱基(含PolyA尾)，整条序列仅包含一个由9186个碱基组成的开放读码框（ORF），编码一条包含3061个氨基酸的多聚蛋白。对所得序列进行BLAST，利用MEGA软件对所测得的PVYN-LN全序列与GenBank中已有的PVY全序列及氨基酸进行系统进化分析，发现PVYN-LN分离物与已报道的PVYN株系具有较高的进化亲缘关系,该分离物属于PVYN株系。序列重组分析软件RDP4分析，该序列无重组。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王芳	沈阳农业大学植物保护学院	23	177	9.0	11.0
3	高正良	安徽省农业科学院烟草所	27	199	8.0	12.0
4	许大凤	安徽省农业科学院烟草所	16	64	4.0	6.0
7	安梦楠	沈阳农业大学植物保护学院	17	34	3.0	5.0
8	周本国	安徽省农业科学院烟草所	21	74	5.0	7.0