马铃薯Y病毒两个黑龙江烟草分离物的 全基因组序列分析

• 作者: 刘永中 姜瀚林 姜鹏超 李向东 程林发 郭兆奎
• 来源期刊: 中国烟草学报
• 关键词: 马铃薯Y病毒 基因组全序列 系统发育分析 重组分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 67-75
• 页数: 9页
• 字数: 4052字
• 语种: 中文

摘要

为明确黑龙江烟区马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到Harbin和MDJ两个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析.结果表明,2个分离物(GenBank登录号分别为MH933741和MH933742)基因组全长均为9699核苷酸.Harbin与MDJ和比利时分离物GBVC 26(JQ969039)一致率最高,为98.5％;MDJ与Harbin和GBVC 26一致率最高,为98.5％.Harbin是美国分离物Oz和瑞士分离物N-605的重组体,MDJ是美国分离物CW和N-605的重组体.利用全基因组序列构建的系统进化树显示,PVY分离物分为9个组,Harbin和MDJ均属PVYN-Wi组.PVY的11个基因均处于负选择,其中NIa蛋白基因的选择压力最大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李向东	山东农业大学植物保护学院	124	1944	23.0	41.0
2	姜鹏超		7	183	3.0	7.0
3	郭兆奎		12	140	6.0	11.0
4	刘永中		3	16	1.0	3.0
5	姜瀚林	山东农业大学植物保护学院	3	2	1.0	1.0
6	程林发	山东农业大学植物保护学院	2	1	1.0	1.0