马铃薯X病毒黑龙江分离物外壳蛋白基因克隆与序列分析

• 作者: 孟宪欣 张威 王魏 申宇 白艳菊 耿宏伟 范国权 高艳玲
• 来源期刊: 黑龙江农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯X病毒 外壳蛋白 核苷酸 序列分析 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 1-5
• 分类号: S435.32
• 字数: 3731字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2767.2010.08.001

摘要

马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)是重要的马铃薯病毒之一,几乎分布于全国所有马铃薯种植区域,严重影响马铃薯的产量和品质.对其建立RT-PCR分子检测体系以及对其外壳蛋白(CP)基因进行序列分析尤为重要.根据已报道的PVX的核苷酸序列设计合成1对引物,以带毒植株总RNA为模板,应用RT-PCR方法,克隆了PVX黑龙江分离物(P2)全长CP基因序列.序列分析表明:P2 CP基因全长711 bp,编码237个氨基酸残基,与GenBank中17 个不同分离物的CP核苷酸序列同源性为75.5%～96.3%,氨基酸序列同源性为89.4%～99.2%.依据PVX CP氨基酸序列建立系统进化树,将PVX不同分离物划分为两大类群,P2与PVX中国分离物亲缘关系较近,同属于类型Ⅱ,表现一定的地域相关性.同时,应用该RT-PCR分子检测体系进行马铃薯样品检测.