3个黑龙江烟区烟草花叶病毒分离物的全基因组序列测定与分析

• 作者: 万秀清 刘文涛 刘永中 姜瀚林 李向东 李现道 郭兆奎
• 来源期刊: 中国烟草学报
• 关键词: 烟草花叶病毒 基因组全序列 系统发育分析 重组分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 77-85
• 页数: 9页
• 字数: 4187字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16472/j.chinatobacco.2018.230

摘要

为明确黑龙江烟区烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到HEB1、HEB2和MDJ三个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析.结果表明,3个分离物全长均为6395核苷酸(GenBank登录号分别为MH595919、MH595920和MH595921).HEB1和MDJ与辽宁分离物Beipiao (HE818412)一致率最高,分别为98.9％和99.6％;HEB2与云南分离物Chuxiong1 (HE818417)一致率最高,为97.1％.HEB1是MDJ和HEB2的重组体.在根据全基因组序列构建的系统进化树中,TMV分为3个组,其中HEB1和MDJ均属Ⅰ (U1)组,HEB2属Ⅱ(Rakkyo)组.TMV的4个基因均处于负选择,其中衣壳蛋白基因的选择压力最大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李向东		124	1944	23.0	41.0
2	万秀清		19	228	10.0	14.0
3	郭兆奎		12	140	6.0	11.0
4	刘文涛		21	127	6.0	10.0
5	李现道		5	30	3.0	5.0
6	刘永中		3	16	1.0	3.0
7	姜瀚林	山东农业大学植物保护学院植物病毒学研究室	3	2	1.0	1.0