条斑紫菜cDNA微阵列制备及其在世代差异基因表达检测中的应用

• 作者: 周晓君 孔凡娜 张学成 王孟强 茅云翔 隋正红
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 条斑紫菜 cDNA微阵列 生物信息学 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2006,（12）
• 所属期刊栏目: 资源环境技术
• 页码范围: 1230-1305
• 页数: 6页
• 分类号: Q94|S6
• 字数: 5372字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2006.12.018

摘要

为了高通量研究不同世代条斑紫菜的基因表达情况,选择了467个包含诸多功能基因的条斑紫菜基因克隆,经PCR扩增纯化后,点样于多聚赖氨酸包被的基片上制备了条斑紫菜功能基因cDNA微阵列.采用Cy3-dCTP和Cy5-dCTP 荧光分别标记条斑紫菜配子体和孢子体cRNA,与阵列进行杂交后,获得了信号清晰、重复性良好的扫描图像.经对标准化处理后的467个基因的数据进行分析发现:在配子体中表达量上调的基因有55个,其中有21个基因与已知功能基因或推测功能基因相匹配;在孢子体中表达量上调的基因有86个,其中与已知功能或假定功能基因相匹配的基因有24个.实验证明,优化的cDNA微阵列制备技术用于条斑紫菜基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张学成	中国海洋大学海洋生命学院	122	1664	22.0	34.0
2	茅云翔	中国海洋大学海洋生命学院	39	535	10.0	22.0
3	隋正红	中国海洋大学海洋生命学院	46	403	10.0	18.0
4	孔凡娜	中国海洋大学海洋生命学院	16	111	7.0	10.0
5	王孟强	中国海洋大学海洋生命学院	2	11	2.0	2.0
6	周晓君	中国海洋大学海洋生命学院	2	36	2.0	2.0