红壤荒草地氨氧化细菌富集液16S rDNA 文库的RFLP分析

• 作者: 孙波 崔中利 张丽娜 曹慧 李大力 李顺鹏
• 来源期刊: 土壤学报
• 学科: 农学
• 关键词: 氨氧化细菌 16S rDNA基因文库 富集液 RFLP 红壤
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 页码范围: 635-641
• 页数: 7页
• 分类号: S154.34|Q938.1
• 字数: 4240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0564-3929.2006.04.016

摘要

分析红壤荒草地富集液中氨氧化细菌的种群组成,选取氨氧化细菌16S rDNA特异性引物序列,利用PCR技术对从富集液中抽提的细菌总DNA进行扩增,并建立了氨氧化细菌特异性的16S rDNA文库.用酶Hha Ⅰ和Rsa Ⅰ对该文库特异性片段进行了限制性酶切片断长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism,RFLP),随机挑选的35个特异性克隆片段被分成3个不同的RFLP类型,其中优势型占了所有分析克隆子的94%,另两个型各占3%.从每个RFLP类型中挑取一定的转化子进行测序,测序结果经GenBank检索,发现在该富集液体系文库中存在大量亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)细菌序列,由此推测红壤荒草地中存在氨氧化细菌,Nitrosomonas属细菌能在富集条件下成为优势菌.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丽娜	南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室	10	389	8.0	10.0
3	孙波	中国科学院南京土壤研究所	143	6805	43.0	80.0
4	崔中利	南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室	49	1368	19.0	36.0
6	曹慧	南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室	30	763	13.0	27.0
9	李大力	南京理工大学化工学院	39	370	11.0	18.0