不同16S rDNA靶序列对DGGE分析活性污泥群落的影响

• 作者: 任南琪 宋佳秀 徐香玲 曲敏 邢德峰
• 来源期刊: 环境科学
• 学科: 地球科学
• 关键词: DGGE 16S rDNA 活性污泥 群落动态 群落多样性
• 年，卷（期）: 2006,（7）
• 页码范围: 1424-1428
• 页数: 5页
• 分类号: X172
• 字数: 3261字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0250-3301.2006.07.033

摘要

为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16S rDNA序列,用DGGE分离PCR扩增产物.研究表明采用不同引物对进行DGGE分析时,群落多样性和动态存在显著的差异.341f/534r和968f/1 401r的靶序列分离效果较好,341f/926r的靶序列分离效果较差.引物341f/534r和341f/926r DGGE图谱显示S2和S3相似性高,引物968f/1 401r DGGE图谱显示S1和S2相似性高.由此可见采用不同引物对进行DGGE分析时,群落结构之间的相似性和动态是不一致的.341f/534r的DGGE图谱中条带丰富,多样性最好,968f/1 401r的DGGE图谱次之,341f/926r DGGE图谱条带最少,多样性也较差.因此,在利用DGGE分析活性污泥样品时采用引物341f/534r和968f/1 401r是比较适宜的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任南琪	哈尔滨工业大学市政环境工程学院	354	8755	48.0	76.0
2	徐香玲	哈尔滨师范大学生命与环境科学学院	97	1621	20.0	36.0
3	邢德峰	哈尔滨工业大学市政环境工程学院	29	1307	17.0	29.0
4	宋佳秀	哈尔滨工业大学市政环境工程学院	10	330	8.0	10.0
5	曲敏	哈尔滨师范大学生命与环境科学学院	42	425	10.0	20.0