河南省部分地区HIV流行毒株的基因序列测定及亚型分析

• 作者: 孙国清 朱新朋 王哲 薛晓玲 袁源 赵飞
• 来源期刊: 河南中医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 亚型 HIV-1 序列测定 流行病 变异
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 艾滋病研究
• 页码范围: 1-3
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 3096字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8999.2006.04.001

摘要

目的:了解河南省内HIV-1流行株的亚型及序列变异特征.方法:在河南省尉氏县采集42例有偿献血HIV-1感染者静脉血,分离单个核细胞(PBMC),用套式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白(env)基因进行扩增,并对其C2-V3及邻区350～450个核苷酸序列进行测定和分析.结果:42份样品间的基因离散率为7.4%.与国际A-E亚型参考序列及部分地区B'亚型代表株序列相比较,河南省尉氏县的42个毒株及流行与我国云南德宏、四川等地的B'亚型毒株序列接近,均属于泰国B'亚型,基因离散率为6.72%系统树分析显示,42份样品仍和泰国B'亚型聚集,远离其他国际亚型.对V3环四肽序列的分析表明,具有泰国B'亚型基因型GPGQ的30例,具有欧美B'亚型的GPGR的7例.结论:根据以上数据及其它资料提示,目前河南省尉氏地区的既往献血人群中,泰国B'亚型依然占主导地位,该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关.但是根据其离散率及系统树的结果提示,既往献血人群中泰国B'亚型有向其他亚型进一步变异的趋势,应引起有关部门的注意.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王哲		104	928	16.0	25.0
2	薛晓玲		22	120	7.0	10.0
3	赵飞		13	49	4.0	6.0
4	袁源		10	34	4.0	5.0
5	孙国清		25	176	9.0	12.0
6	朱新朋		10	47	5.0	6.0