植物miRNAs前体的生物信息分析

• 作者: 何晨 谭军 陈薇
• 来源期刊: 重庆邮电学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 miRNAs 最小自由能 长度 熵
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 生物信息 数学
• 页码范围: 803-808
• 页数: 6页
• 分类号: Q754
• 字数: 4458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-825X.2006.06.033

摘要

miRNAs前体(pre-miRNAs)是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能形成较为稳定的发卡环结构,具有较低的最小折叠自由能(minimal folding free energy,MFE).在对植物pre-miRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上,重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值(MFEL).结果表明MFEL是区分植物premiRNAs的一个很有效的参数:pre-miRNAs的MFEL值平均为-45.98 kcal/mol,明显低于mRNAs(-23.08 kcal/mol),tRNAs(-22.13 kcal/mol)和rRNAs(-16.83 kcal/mol).使用MFEL参数可提高预测植物miRNAs基因的效率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈薇		1	6	1.0	1.0
2	谭军		1	6	1.0	1.0
3	何晨		1	6	1.0	1.0