血管肉瘤相关miRNAs的生物信息学预测及分析

• 作者: 庞丽娟 张海俊 张璐 李丽 贾薇 邹泓 金珊 魏院锋
• 来源期刊: 临床与实验病理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 血管肉瘤 miRNAs 生物信息学 信号通路
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 431-435
• 页数: 5页
• 分类号: R732.2
• 字数: 3673字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13315/j.cnki.cjcep.2020.04.011

摘要

目的 探讨血管肉瘤相关miRNAs及其靶基因在其恶性生物学行为中的作用.方法 从GEO数据库中下载血管肉瘤miRNAs表达谱芯片数据,应用GEO2R筛选出差异表达的miRNAs并进行靶基因预测,对靶基因进行GO及KEGG生物功能富集分析及蛋白互作分析.结果 筛选出53个差异表达的miRNAs (P＜0.05,| log fold-change| ≥4),其中上调者51个,下调者2个;GO功能富集分析发现差异表达miRNAs的靶基因主要参与细胞通讯、信号转导等生物学过程;KEGG信号通路富集分析发现靶基因主要参与肿瘤信号通路、代谢通路、环腺苷酸(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K/AKT信号通路、Ras信号通路等重要通路;String蛋白互作分析发现,STAT3、TP53、MAPK1、SRC等在蛋白互作网络中处于核心地位.结论 异常表达的miRNAs在血管肉瘤的恶性生物学行为中发挥着关键作用,为进一步探讨血管肉瘤发生、发展的具体分子机制、分子标志物的筛选及靶向药物的开发奠定基础.