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猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析
猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析
作者:
凌飞
张豪
朱良瑞
李加琪
李晓筠
梅盈洁
王翀
陈瑶生
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
猪
溶酶体组织蛋白酶D
电子克隆
快速扩增cDNA末端
全长cDNA
摘要:
以人CTSD mRNA全长序列为基序,在db EST库中搜索同源性大于80%、重叠大于40个碱基的猪EST下载经Seqman软件装配后,利用RT-PCR扩增到猪CTSD基因部分cDNA序列,进一步通过RACE技术获得cDNA全长(GenBank登录号为DQ018727),猪CTSD基因cDNA全长2 032 bp包括93 bp 5'UTR区、706 bp 3'UTR区和1 233bp ORF,编码410个氨基酸残基.其编码区与人、鼠、牛、羊CTSD编码区同源性分别为87.9%、78.2%、86.6%和85.0%,其氨基酸序列与人、鼠、牛、羊氨基酸序列同源性分别为86.6%、80.1%、86.0%和84.7%.疏水性分析和信号肽预测发现猪CTSD氨基酸序列存在至少7个疏水性区域,信号肽位点为第1~20 个氨基酸残基.在NCBI进行Blast P搜索结果显示猪CTSD氨基酸结构中含有Asn(Asparagine,天门冬酰胺)结构域,与天冬氨酸蛋白酶3D结构同源性高达99.7%,具有真核生物天冬氨酸蛋白酶的典型结构.以猪多组织RNA池为模板,以1 026 bp部分cDNA序列作为杂交探针进行Northern杂交,得到一条2 000 bp左右特异条带,从而验证了RACE产物为全长cDNA并揭示该基因只有一个转录本.为了研究猪CTSD基因在体内不同组织内表达的特点,采用半定量RT-PCR对CTSD基因在猪10个组织中的表达进行研究,结果表明在10个组织中均有表达,且表达量与β-actin内参接近.
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内容分析
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相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
猪
溶酶体组织蛋白酶D
电子克隆
快速扩增cDNA末端
全长cDNA
年,卷(期)
2007,(5)
所属期刊栏目
遗传繁育
研究方向
页码范围
432-436
页数
5页
分类号
S828.2
字数
4192字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0366-6964.2007.05.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张豪
华南农业大学动物科学学院
48
298
10.0
15.0
2
李加琪
华南农业大学动物科学学院
57
384
11.0
17.0
3
梅盈洁
华南农业大学动物科学学院
8
41
4.0
6.0
4
王翀
华南农业大学动物科学学院
52
298
12.0
15.0
5
陈瑶生
华南农业大学动物科学学院
22
347
13.0
18.0
6
凌飞
华南农业大学动物科学学院
15
119
6.0
10.0
7
李晓筠
华南农业大学动物科学学院
1
13
1.0
1.0
8
朱良瑞
华南农业大学动物科学学院
2
14
1.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
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引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
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节点文献
引证文献
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同被引文献
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二级引证文献
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1979(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1984(1)
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1985(2)
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1986(1)
参考文献(1)
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1990(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
1995(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
1997(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1999(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
2007(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2008(2)
引证文献(2)
二级引证文献(0)
2011(5)
引证文献(4)
二级引证文献(1)
2012(4)
引证文献(3)
二级引证文献(1)
2013(5)
引证文献(1)
二级引证文献(4)
2014(4)
引证文献(1)
二级引证文献(3)
2015(2)
引证文献(1)
二级引证文献(1)
2016(8)
引证文献(1)
二级引证文献(7)
2017(3)
引证文献(0)
二级引证文献(3)
2019(2)
引证文献(0)
二级引证文献(2)
研究主题发展历程
节点文献
猪
溶酶体组织蛋白酶D
电子克隆
快速扩增cDNA末端
全长cDNA
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
相关基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:
National Basic Research Program of China
官方网址:
http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:
农业
广东省自然科学基金
英文译名:
Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:
http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:
研究团队
学科类型:
期刊文献
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畜牧兽医学报2007年第9期
畜牧兽医学报2007年第8期
畜牧兽医学报2007年第7期
畜牧兽医学报2007年第6期
畜牧兽医学报2007年第5期
畜牧兽医学报2007年第4期
畜牧兽医学报2007年第3期
畜牧兽医学报2007年第2期
畜牧兽医学报2007年第12期
畜牧兽医学报2007年第11期
畜牧兽医学报2007年第10期
畜牧兽医学报2007年第1期
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