广西HIV-1重组流行株env基因V3-V4区序列变异分析

• 作者: 卢灿健 张志勇 梁浩 沈菁 罗皓 邢辉 邵一鸣
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒1型 基因变异 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（16）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 3028-3031
• 页数: 4页
• 分类号: Q319+.1
• 字数: 2440字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8507.2007.16.011

摘要

[目的]分析广西HIV-1重组流行株env基因V3-V4区及其临近区域的基因变异.[方法]应用nest-PCR对24份来自广西主要流行区的HIV-1重组毒株env基因区进行扩增后,使用ABI 310型测序仪测序,然后应用CLUSTAL、MEGA和dnatools等生物学软件对env基因区V3-V4区及其临近区域进行序列分析.[结果]24份毒株中21份为CRF01-AE(93.48%),3份为CRF08-BC(6.52%);系统树分析显示,21份与分离于广西地区的CRF01-AE.97CNGX2f和泰国代表毒株THCM240接近,3份CRF08-BC重组毒株中有2份与CRF08-BC.98CN006和CRF08-BC.97CNGX6f靠近,还有1份样本则接近C.95IN21068;env基因V3-V4区核苷酸序列分析显示,广西的样本与分离于该地区的代表毒株基因距离较小,CRF01-AE和CRF08-BC重组毒株的氨基酸替换主要发生在C3和V4区,而V3区氨基酸序列相对保守.[结论]CRF01-AE重组毒株env基因V3-V4区的变异主要发生在C3和V4区,而不是V3区.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢辉		75	447	11.0	17.0
2	邵一鸣		140	694	14.0	20.0
3	梁浩	广西医科大学艾滋病研究中心	43	229	9.0	12.0
4	张志勇	广西医科大学艾滋病研究中心	135	815	15.0	20.0
5	沈菁	广西医科大学艾滋病研究中心	24	76	6.0	7.0
6	罗皓	广东医学院公共卫生学院	32	201	7.0	13.0
7	卢灿健		10	54	3.0	7.0