广西1例HIV-1 G亚型毒株全长基因序列的测定和分析

• 作者: 张敏 李天一 李敬云 李林 梁冰玉 沈平 苏齐鉴
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 G亚型 近似全长序列 系统进化树分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 101-105
• 页数: 5页
• 分类号: R512.91|R373
• 字数: 3444字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2017.02.005

摘要

目的 对广西1例HIV-1 G亚型毒株感染者体内病毒近似全长基因组进行序列测定并进行系统进化分析.方法 对前期鉴定的1例HIV-1G亚型毒株感染者进行背景信息收集,并采集其外周血,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术分两段扩增并测定病毒近似全长基因序列.利用MEGA6软件对全长序列进行系统进化分析.结果 获得了病毒近似全长基因组序列,长度为8847 bp.在系统进化树中,该毒株与G亚型参考株成簇,Bootstrap值为100%.系统溯源分析显示,该毒株与广西首次报道的G亚型JN106043毒株关系最近(Bootstrap值为100%,基因离散率为5%).结论 该毒株可能是由广西毒株传播所致,提示G亚型毒株在广西地区可能存在一定的局部流行,需进一步监测.该毒株序列的测定和分析对于广西地区HIV流行状况分析具有重要意义.