广西首例HIV-1G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

• 作者: 刘伟 李天一 李敬云 李林 梁淑家 陈立力
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: G亚型,HIV-1 近似全长序列 系统进化树分析 基因组
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 192-195
• 分类号: R512.91
• 字数: 3209字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2012.03.007

摘要

目的 获得广西首例HIV-1G亚型毒株全长基因组序列并分析其来源.方法 采集1例广西HIV感染者血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,利用MEGA软件对全长序列进行系统进化分析.结果 获得了8800 bp长度的近似全长基因组序列,系统发育分析结果显示该毒株与HV-1G亚型参考株成簇,Bootstrap值为99%,通过与世界上其他地区流行的HIV-1G亚型毒株进行亲缘分析,该毒株与喀麦隆流行毒株的关系最近.结论 在广西发现了首例HIV-1G亚型感染者,推测该毒株是由境外传入的,应对广西地区流行的HIV-1毒株的来源和变异进行密切监测.