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3株H9N2亚型禽流感病毒广西分离株全基因组序列的测定与分析
3株H9N2亚型禽流感病毒广西分离株全基因组序列的测定与分析
作者:
刘加波
唐小飞
庞耀珊
董建宝
谢志勤
谢芝勋
邓显文
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
禽流感
H9N2亚型
全基因组
测定与分析
摘要:
目的 对3株H9N2亚型禽流感病毒进行全基因序列的测定与分析.方法根据GenBank公布的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的全基因序列,设计了8对引物,运用RT-PCR 方法获取了3株H9N2亚型AIV广西地方分离株A/Chicken/Guangxi/1/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00的全基因序列,并对所得序列进行了比较分析.结果同源性分析及遗传进化分析发现,所分离的3个毒株的各基因与A/Chicken/Guangdong/4/00和A/Chicken/Jiangsu/1/00的相应基因的核苷酸序列有着较高的同源性和较近的亲缘关系,可能起源于同一种系.所分离毒株中每个毒株的8个基因,在遗传进化树上的分支不具有统一性,说明此3个毒株可能为不同基因亚系间发生自然重排的产物.氨基酸序列比较发现,A/Chicken/Guangxi/1/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00 3株AIV的na基因核苷酸序列在开放性阅读框架的187~195位均缺失了ACAGAGATA共9个核苷酸,它们所编码的氨基酸为T、E、I.3个分离株的HA蛋白第226位氨基酸均为Gln,证明它们为人类非易感性的H9N2亚型AIV.结论此3株H9N2亚型流感病毒为基因自然重排的产物,其na基因均存在缺失,且从分子水平上证明它们对人类不具有易感性.
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文献信息
篇名
3株H9N2亚型禽流感病毒广西分离株全基因组序列的测定与分析
来源期刊
中国人兽共患病学报
学科
农学
关键词
禽流感
H9N2亚型
全基因组
测定与分析
年,卷(期)
2007,(9)
所属期刊栏目
实验研究
研究方向
页码范围
916-922,926
页数
8页
分类号
S852.6
字数
5847字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2007.09.018
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
被引次数
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1
刘加波
118
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21.0
29.0
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谢芝勋
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谢志勤
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唐小飞
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16.0
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5
庞耀珊
118
1412
21.0
30.0
6
邓显文
118
1428
21.0
30.0
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董建宝
8
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中国人兽共患病学报
主办单位:
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-2694
CN:
35-1284/R
开本:
大16开
出版地:
福建省福州市津泰路76号
邮发代号:
34-46
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
6893
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中国人兽共患病学报2007年第6期
中国人兽共患病学报2007年第5期
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