基于离散小波变换的蛋白质结构、功能与进化关系延时交叉相关分析

• 作者: 梁汝萍 莫金垣 邱建丁
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 序列小波层次相关法 蛋白质 结构 功能 进化
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 页码范围: 40-45
• 页数: 6页
• 分类号: O657|Q61
• 字数: 4597字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0251-0790.2007.01.008

摘要

基于氨基酸的疏水特性,将离散小波变换与延时交叉相关分析相结合,提出了一种分析蛋白质结构、功能和进化关系的新方法--序列小波层次相关法.以丝氨酸蛋白酶超家族中Trypsin种属为研究对象,描述了该方法在揭示不同物种的Trypsin蛋白质进化关系中的应用;以蛋白质酪氨酸磷酸酶、血红蛋白和溶菌酶为例,采用该方法揭示了蛋白质之间功能与序列的内在关系.该方法为非参数方法,具有简单、直观、可视和可操作性强等特点,且不需要事先知道蛋白质的结构,仅从蛋白质的氨基酸序列出发即可比较和揭示蛋白质之间的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	莫金垣	中山大学化学与化学工程学院	188	2414	27.0	35.0
2	梁汝萍	南昌大学化学系	27	60	4.0	6.0
3	邱建丁	南昌大学化学系	28	66	4.0	7.0