角毛壳菌降解粗纤维基因的筛选

• 作者: 张海燕 杨谦
• 来源期刊: 林产化学与工业
• 学科: 工学
• 关键词: 角毛壳菌菌丝体 cDNA文库 表达序列标签 生物信息学分析 降解粗纤维基因
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: TQ352
• 字数: 4012字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-2417.2007.03.005

摘要

以角毛壳菌菌丝体为材料,构建cDNA文库并进行了部分表达序列标签(ESTs)的分析.文库的滴度为1.02×106 pfu/mL,重组率为 95.3%,插入片段平均长度大于 1.2 kb.在cDNA文库中随机选择克隆从5'端测序得到 1 219 个高质量ESTs,拼接为804条独立基因.其中460条(57.2%)与NCBI中非冗余蛋白质库(NR)已知基因有不同程度同源性的代表已知功能基因,344(42.8%)条独立基因与NR库中基因没有显著同源性的代表未知功能新基因.从已知基因中鉴定出了降解粗纤维的基因:β-1,4-内切葡聚糖酶基因、β-葡萄糖苷酶基因、β-内切木聚糖酶基因、木糖苷酶基因、漆酶基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨谦	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	191	3458	29.0	49.0
2	张海燕	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	15	146	6.0	12.0