SARS冠状病毒基因溯源分子生物信息学分析

• 作者: 张家敏 王志刚
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: SARS冠状病毒 SARS样冠状病毒 基因分型 溯源 病毒原型
• 年，卷（期）: 2007,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1586-1590
• 页数: 5页
• 分类号: R512.99
• 字数: 4085字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-8685.2007.09.020

摘要

目的:对广东省两次流行的SARS冠状病毒(SARS-CoV)进行分子水平的溯源分析,为进一步研究SARS冠状病毒提供分子生物信息学资料.方法:对GenBank登录的SARS冠状病毒和SARS样冠状病毒(SARS-like CoV)核酸序列进行了分析,以Breda病毒为外组,构建了SARS冠状病毒和SARS样冠状病毒系统进化树,并进行单核苷酸变异分析.结果:发现两次SARS自然流行的病毒可分为两个明显不同的聚类;第二次流行时从人类中分离的SARS冠状病毒和从果子狸等动物中分离的SARS样冠状病毒可分为两个基因型,两型的主要鉴别依据是病毒的全基因组变异而非Spike基因序列.结论:前后两次SARS自然流行病毒可能以不同的特性感染人类而不是简单的重复.结合流行病学资料,对第二次流行时的SARS冠状病毒进行分子水平溯源分析的结果表明,分离白前2例指标患者的病毒基因序列与来自果子狸等动物的SARS样冠状病毒的基因序列存在较大的差异.提示第二次流行的SARS冠状病毒由果子狸等动物传染人的论据不足.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王志刚		22	299	7.0	17.0
2	张家敏		13	56	4.0	7.0