桃拉病毒基因组的生物信息学分析

• 作者: 刘露 李伟哲 肖勤 贾阳阳
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 桃拉病毒 基因 蛋白质 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 119-122
• 页数: 4页
• 分类号: S945.4
• 字数: 3330字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2019.08.030

摘要

[目的]对桃拉病毒(Taura syndrome virus,TSV)的完整基因组进行生物信息学分析.[方法]通过生物信息学方法对基因序列组成、开放阅读框、蛋白质理化性质、二级结构预测分析、蛋白跨膜结构的存在与否、蛋白信号肽存在与否以及蛋白质三级结构进行了预测分析.[结果]登录NCBI网站下载TSV(JX094350.1)10128 bp的基因片段,经生物信息学分析,编码氨基酸3286个,理论等电点(pI)为5.14,相对分子质量为366443.00 Da,不稳定系数(Ⅱ)为37.76,属于稳定蛋白质;完整基因序列中包含2个开放阅读框(open reading frame,ORF);蛋白中存在跨膜结构;没有蛋白信号肽.[结论]对TSV的生物信息学分析有助于在分子水平上了解桃拉病毒的基因结构以及预测其感染机制,可为预防和治疗虾类的桃拉综合征提供有用的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖勤	河北农业大学海洋学院	12	117	4.0	10.0
2	刘露	河北农业大学海洋学院	7	5	1.0	2.0
3	李伟哲	河北农业大学生命科学学院	4	5	1.0	2.0
4	贾阳阳	河北农业大学海洋学院	1	0	0.0	0.0