HIV-1重组毒株gag区快速基因分型方法

• 作者: 刘伟 卢灿健 张志勇 梁浩 沈菁 罗皓 邢辉 邵一鸣
• 来源期刊: 中国公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒1型 基因型 聚合酶链反应
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 450-452
• 页数: 3页
• 分类号: R181.2+3
• 字数: 2972字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-0580.2007.04.027

摘要

目的 建立一种简便、快速基因分型方法,对广西人类免疫缺陷病毒(HIV-1)重组毒株gag基因区进行亚型鉴定.方法 从HIV阳性样本中提取核酸,使用HIV-1 M组通用引物对gag区进行第1轮扩增,第2轮使用分别检测C亚型和CRF01-AE重组型的二套特异性引物放入同一反应管中进行扩增,根据不同亚型扩增的目的带位置不同判断亚型.另外设计了一套引物,专门用于检测B'/C重组毒株.扩增出的所有样本均进行基因测序和系统树分析以验证结果.结果 54份样本中,经基因测序和系统树分析证实CRF08-BC样本4份(7.41%),CRF01-AE样本46份(85.18%),4份(7.41)无法确定亚型.经亚型特异性引物PCR法检测出4份(100%)B'/C重组毒株,45份(97.83%)CRF01-AE重组毒株,灵敏度为98%,特异性为100%.2种方法检测结果经差异性检验显示,P＞0.05,差异无统计学意义,结果一致性高达98.15%.与基因分析结果吻合.重复实验显示,B'/C的平均重复性为100%(20/20),CRF01-AE为98.3%(59/60).结论 该方法具有简便、快速,高度灵敏度和特异性的特点,可直接对广西HIV-1重组毒株CRFO 1-AE gag基因区进行分型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢辉	中国疾病顶防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室	75	447	11.0	17.0
2	梁浩	广西医科大学艾滋病研究中心	43	229	9.0	12.0
3	张志勇	广西医科大学艾滋病研究中心	135	815	15.0	20.0
4	刘伟	广西医科大学艾滋病研究中心	27	125	6.0	9.0
5	邵一鸣	广西医科大学艾滋病研究中心	3	14	3.0	3.0
7	罗皓		1	4	1.0	1.0
10	卢灿健	中国疾病顶防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室	1	4	1.0	1.0
11	沈菁		1	4	1.0	1.0