H5N1亚型高致病性禽流感病毒NS1基因的克隆及其序列分析

• 作者: 于孟斌 周晓巍 张传福 朱恒奇 杨予涛 杨志新 王荣 蒋世卫 许龙 赵丽霞 黄培堂
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 禽流感 H5N1亚型 NS1基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 942-945
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 2662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2007.06.016

摘要

目的:克隆H5N1亚型禽流感病毒的NS1基因,并分析其序列特性.方法:通过RT-PCR方法克隆H5N1亚型禽流感病毒NS1基因,并对该基因片段进行测序,将此序列与数据库中不同时间、地点、宿主来源的H5N1亚型流感毒株NS1基因序列进行同源性比较.结果:获得了678 bp的NS1全长基因,可编码225个氨基酸;其与毒株A/chicken/Jilin/hq/2003的同源性最高,二者的核酸和氨基酸的同源性分别为99.7%和99.1%.比对分析发现,该毒株NS1基因在第238-252位有15个核苷酸的缺失;进化树分析表明,它与1997年香港流行的H5N1亚型禽流感病毒毒株分别属于2个不同的分支.结论:克隆了一株H5N1亚型禽流感病毒的NS1基因,并初步分析了其序列特性,为进一步研究NS1基因的功能奠定了基础.