肝炎诊断芯片60-mer长链寡核苷酸探针的设计研究

• 作者: 危敏 孙朝晖 王蜀燕 郑文岭 马文丽
• 来源期刊: 军医进修学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肝炎病毒,乙型 肝炎病毒,丁型 肝炎病毒,丙型 基因芯片 寡核苷酸探针 计算生物学 软件
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 63-65
• 页数: 3页
• 分类号: R373.33
• 字数: 1734字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-1139.2007.01.025

摘要

目的:通过生物信息学软件对易引起慢性肝炎的三种肝炎病毒基因组结构进行分析,设计肝炎病毒诊断分型芯片的寡核苷酸(Oligo)探针.方法:利用BLAST软件对乙型肝炎病毒(HBV)、丁型肝炎病毒(HDV)、丙型肝炎病毒(HCV)6个亚型的DNA及cDNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;然后用生物信息学软件Array designeR3.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针.结果:获得156条60-mer探针,用于打印成DNA芯片,进行HBV、HDV的联合检测和HCV的基因分型.结论:利用BLAST检索系统和生物学软件Array designeR3.0设计肝炎病毒诊断分型芯片的探针,是一种简便可行、有效的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙朝晖	广州军区广州总医院检验科	99	504	11.0	18.0
2	王蜀燕	广州军区广州总医院检验科	25	90	5.0	7.0
3	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
4	郑文岭	南方医科大学基因工程研究所	121	603	11.0	20.0
5	危敏	南方医科大学基因工程研究所	28	74	5.0	6.0