植物病毒检测芯片的杂交条件优化

• 作者: 丁先锋 徐根明 朱聪 郭江峰
• 来源期刊: 中国生物工程杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 寡核苷酸 PC 探针 检测
• 年，卷（期）: 2007,（10）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 75-80
• 页数: 6页
• 分类号: Q819
• 字数: 5024字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8135.2007.10.015

摘要

利用芯片点样仪将5种侵染马铃薯的病毒/类病毒(苜蓿花叶病毒、黄瓜花叶病毒、黄瓜花叶病毒-卫星病毒、马铃薯病毒Y、马铃薯块茎纺锤状类病毒)的保守区寡核苷酸(Oligonucleotide,oligo)探针和PCR探针点样于玻片,并以植物18S rRNA作为内参照制成基因芯片.研究探针浓度、杂交时间、杂交温度以及点样液对芯片杂交的影响,并验证优化后病毒检测芯片的特异性.结果表明,寡核苷酸探针浓度介于5～20 μmol/L之间对杂交信号强度影响不大,PCR探针浓度与杂交信号强度间呈线性关系;在45℃杂交4 h时,芯片的杂交信号最强,且该条件下进行杂交对两种探针芯片的影响趋势一致;点样液中以DMSO的杂交效果最好.经过整体条件优化后的两种探针芯片在杂交检测上具有较高的特异性,适于检测植物病毒.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭江峰	浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所	52	222	8.0	13.0
2	丁先锋	浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所	44	201	9.0	12.0
3	朱聪	浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所	6	42	4.0	6.0
4	徐根明	浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所	2	46	2.0	2.0