数目可变串联重复序列用于江苏省168株结核分枝杆菌菌株的基因分型研究

• 作者: 吕华坤 周扬 杨丹丹 虞浩 许卫国
• 来源期刊: 南京医科大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 多位点数目可变串联重复序列分析 基因分型
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 流行病学研究
• 页码范围: 1509-1512,1516
• 页数: 5页
• 分类号: R181.81
• 字数: 2792字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-4368.2007.12.054

摘要

目的:初步了解江苏省结核分枝杆菌临床分离菌株的数目可变串联重复序列(Variable number of tandem repeats,VNTR)的基因型及VNTR基因分布特征.方法:在苏南、苏中、苏北三个地区13个结核病定点诊疗单位收集临床分离菌株.选取结核分枝杆菌基因组中11个具有明显多态性特征的VNTR位点,通过PCR扩增,2%琼脂糖凝胶电泳和Bio Numerics(Version 3.0)软件进行结核菌株VNTR的多态性和聚类分析.结果:共收集到168株结核分枝杆菌.不同的菌株在同一位点上具有多态性.共分为10个基因型(Ⅰ,Ⅱ～Ⅹ型),其中以Ⅷ型为主要基因型,占75.0%、其次为Ⅱ型5.4%、Ⅳ型4.2%、Ⅶ型9.5%.不同地区之间,苏南、苏中、苏北三个地区也都以Ⅷ型为主要基因型,分别占各地区的83.5%,57.1%,76.6%;但是苏南、苏中、苏北三地的Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅶ型菌株分布在各地菌株中的比例有差异显著性(χ2=54.710,P＜0.0001),Ⅱ型以苏中为主(11.9%)、Ⅲ型以苏南为主(3.8%)、Ⅳ型以苏南、苏北为主(5.1%与6.4%)、Ⅶ型以苏中为主(31.0%).结论:江苏省的结核分枝杆菌具有明显的多态性,以Ⅷ型为主要流行型,不同地区间同样以Ⅷ型为主要流行型,但菌型分布存在一定的差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	虞浩	江苏省疾病预防控制中心慢传科	23	243	10.0	15.0
2	周扬	江苏省疾病预防控制中心慢传科	23	224	9.0	14.0
3	许卫国	江苏省疾病预防控制中心慢传科	64	818	16.0	23.0
4	杨丹丹	江苏省疾病预防控制中心慢传科	15	118	6.0	10.0
5	吕华坤	江苏省疾病预防控制中心慢传科	1	10	1.0	1.0